Богослужения возобновились в 1945 году и продолжались почти двадцать лет. В 1962 году здание храма Покрова Пресвятой Богоматери передали Судакской средней школе для организации в нем Дворца пионеров. В 80-е годы здесь находилась мастерская по ремонту телевизоров.

Вернули храм Православной Церкви в 1990 году. В 1996 году в церкви появилась роспись, изображающая Крымских святых, ее автор -художник И. Сахаров.