У 1931 році при передачі будівлі Тосоавіахіму склеп був розкритий, останки адміралів знищені. У час Великої Вітчизняної війни храм серйозно постраждав. У 1991 році спеціальна комісія обстежувала склеп, і виявила серед сміття лише уламки кісток, які в 1992 році урочисто перепоховали.