Во время пожара 1683 г., которая опустошила весь город, собор сильно пострадал и был восстановлен лишь в 1753 г. Униаты переделали византийскую архитектуру храма на латинский манер. В 1772 г. собор пришел в запустение. Использовался как «казенный магазин» (склад). На 1829 г. он превратился в сплошную руину — обвалились своды и купол.