Кроме Даниила, другие паломники пишут о том, что поверх Молочной пещеры стоит церковь святых Павлы и Евстахии; существуют и другие идентификации места Молочной пещеры. По-видимому, изначально она помещалась в греческом монастыре св. Николая. К концу XIV в. его здания были уже разрушены, и в 1375 г. специальной папской буллой францисканцам было разрешено перестроить церковь; участок стал их собственностью с конца XV в. и остается таковой до сих пор.